質(zhì)粒提取原理
現(xiàn)在較常用的質(zhì)粒提取方法有三種:堿裂解法、煮沸法和去污劑裂解法,前兩種方法較為劇烈,適用于較小的質(zhì)粒(<15Kb),而去污劑裂解法則比較溫合,一般用于分子量較大的質(zhì)粒(>15Kb)。
堿裂解法是一種廣泛使用的制備質(zhì)粒DNA的方法。其原理為:染色體DNA遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于質(zhì)粒DNA,染色體DNA為線狀分子,而質(zhì)粒為共價(jià)閉合環(huán)狀分子。當(dāng)pH 12.0-12.6堿性環(huán)境中,線性的大分子的染色體DNA完quan變性,而共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA在將PH調(diào)至中性后即可以恢復(fù)其天然構(gòu)象,在高鹽濃度存在的條件下,染色體DNA和蛋白質(zhì)在去污劑SDS的作用下形成沉淀,而質(zhì)粒DNA仍為可溶狀態(tài),通過離心可除去大部分細(xì)胞碎片、染色體DNA、RNA及蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA仍在上清中。
質(zhì)粒提取常見問題分析
1、影響質(zhì)粒提取的因素有哪些?
質(zhì)粒提取的得率和質(zhì)量與很多因素有關(guān),如宿主菌的種類和培養(yǎng)條件、細(xì)菌細(xì)胞的裂解、質(zhì)粒拷貝數(shù)、質(zhì)粒的穩(wěn)定性、抗生素、吸附膜的吸附能力、提取操作的熟練程度等等。
2、為什么從革蘭氏陽性菌中提取質(zhì)粒要在懸浮液中加入溶jun酶?
革蘭氏陽性菌有一層細(xì)胞壁,必須加入溶jun酶才能使之溶解。
3、如何根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要選擇不同級(jí)別的產(chǎn)品?
從純度上:各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、測序、文庫篩選、連接和轉(zhuǎn)化,普通純度的質(zhì)粒可以滿足要求;而對(duì)于轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),則要求使用高純度質(zhì)粒提取試劑盒方能滿足要求。
從提取的量上:1-20μg,應(yīng)選擇小量提取試劑盒;20-40μg,應(yīng)選擇中量提取試劑盒;大于40μg,應(yīng)選擇大量提取試劑盒。
從宿主菌上:分為普通細(xì)菌質(zhì)粒提取試劑盒、G+菌質(zhì)粒提取試劑盒和酵母菌質(zhì)粒提取試劑盒,根據(jù)情況進(jìn)行選擇。